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Species belonging to selected taxon:

Aquilegia formosa x Aquilegia pubescens, Eschscholzia californica, Papaver somniferum



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000057
species: Aquilegia formosa x Aquilegia pubescens
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Aquilegia formosa x Aquilegia pubescens Aquilegia Ranunculaceae Ranunculales stem eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATACTCCCTCTGTCCCAAATT

miRNA*
TTTGGGACGGAGGGAGTATGA

mismatches: 0
bulges: 0

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pre-miRNA
ATGTACAACATTGTTTATTTGATACTCCCTCTGTCCCAAATTATAAGTACCTTATTCCATTTTAGATTGTCCCAAAATATATGTCGCTTTTGACTTTTCA
ACACATATTAATTAAGTTAAATGGTTCATTTGTCTATACTATCCTTGCTTTAAGATTAGAGTAATTATTCTAATGAAAAGTTAGACATTGTAATTAGTAT
TAAATAGGGGTAAATTAGAAAATAGAATTAGTAGACAAACAATAAATGATGTTTCCTTAATAAATAGAATATTCTAAAAGGTACTTATAATTTGGGACGG
AGGGAGTATGA
ACAAACAGTATCTTTATT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD osa-miRf11090-akr: 0.00007

microPC miR1439: 0.00007
UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.000005
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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